Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MKLN1Q9UL63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MKLN1Q9UL63 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms