Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB21Q9UL25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB21Q9UL25 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB21Q9UL25 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms