Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIMS3Q9UJD0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RIMS3Q9UJD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms