Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAI1Q9UI46 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DNAI1Q9UI46 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAI1Q9UI46 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAI1Q9UI46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms