Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLIP2Q9UDT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIP2Q9UDT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms