Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf48Q9UBA6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms