Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CC2D2AQ9P2K1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CC2D2AQ9P2K1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CC2D2AQ9P2K1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms