Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SENP1Q9P0U3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SENP1Q9P0U3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SENP1Q9P0U3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms