Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK4Q9NYG8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK4Q9NYG8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNK4Q9NYG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms