Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NHP2Q9NX24 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NHP2Q9NX24 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms