Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD4Q9NVD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD4Q9NVD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SETD4Q9NVD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms