Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31BQ9NQW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC31BQ9NQW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms