Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NECTIN3Q9NQS3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECTIN3Q9NQS3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECTIN3Q9NQS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms