Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH12Q9NPG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH12Q9NPG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH12Q9NPG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms