Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF4Q9H2L5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF4Q9H2L5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms