Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG9Q9H0W8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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