Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTDSP1Q9GZU7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms