Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBX4Q9BYU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PBX4Q9BYU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX4Q9BYU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms