Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP89Q96ST8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP89Q96ST8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP89Q96ST8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP89Q96ST8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms