Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCLT1Q96NL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCLT1Q96NL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCLT1Q96NL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms