Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LOXL4Q96JB6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LOXL4Q96JB6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LOXL4Q96JB6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LOXL4Q96JB6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LOXL4Q96JB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms