Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIG1Q96JA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIG1Q96JA1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIG1Q96JA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIG1Q96JA1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms