Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3CQ96E17 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3CQ96E17 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3CQ96E17 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms