Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TMEM143Q96AN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM143Q96AN5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM143Q96AN5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM143Q96AN5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms