Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX4Q969G2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX4Q969G2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms