Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCG3Q8WXD2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCG3Q8WXD2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms