Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf54Q8WWF1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf54Q8WWF1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms