Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C15orf40Q8WUR7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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C15orf40Q8WUR7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C15orf40Q8WUR7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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