Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF217Q8TC41 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF217Q8TC41 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF217Q8TC41 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms