Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLIP4Q8N3C7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP4Q8N3C7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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