Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB11FIP4Q86YS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms