Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG9AQ7Z3C6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG9AQ7Z3C6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG9AQ7Z3C6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms