Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BEND4Q6ZU67 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BEND4Q6ZU67 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BEND4Q6ZU67 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms