Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F5

TRIM40, Tripartite motif-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM40Q6P9F5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM40Q6P9F5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM40Q6P9F5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM40Q6P9F5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms