Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF544Q6NX49 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF544Q6NX49 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF544Q6NX49 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms