Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RCSD1Q6JBY9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms