Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCAPH2Q6IBW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCAPH2Q6IBW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms