Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REP15Q6BDI9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REP15Q6BDI9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms