Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFMBT2Q5VUG0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SFMBT2Q5VUG0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms