Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms