Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF542PQ5EBM4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF542PQ5EBM4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms