Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q56UQ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q56UQ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q56UQ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q56UQ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q56UQ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q56UQ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q56UQ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q56UQ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms