Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CEP55Q53EZ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP55Q53EZ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP55Q53EZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms