Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF212Q495C1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF212Q495C1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms