Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UVSSAQ2YD98 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UVSSAQ2YD98 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UVSSAQ2YD98 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms