Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 THOC2-203ENST00000416618 657 ntTSL 55.85□□□□□ -1.471e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 55.82□□□□□ -1.482e-8■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 55.8□□□□□ -1.481e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-219ENST00000497887 768 ntTSL 35.71□□□□□ -1.51e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.511e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 55.51□□□□□ -1.531e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-210ENST00000455053 573 ntTSL 35.39□□□□□ -1.551e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.561e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-205ENST00000432353 3188 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.561e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 PRPF4B-202ENST00000461612 629 ntTSL 24.89□□□□□ -1.631e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 34.72□□□□□ -1.651e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.762e-8■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.821e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 53.26□□□□□ -1.891e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 IVNS1ABP-207ENST00000480769 3776 ntTSL 1 (best)3.11□□□□□ -1.911e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.991e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.091e-5■■■□□ 19.1
SRSF7Q16629 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.671e-7■■■□□ 19
SRSF7Q16629 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 19
SRSF7Q16629 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -11e-7■■■□□ 19
SRSF7Q16629 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 311.62□□□□□ -0.551e-8■■■□□ 19
SRSF7Q16629 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 211.09□□□□□ -0.631e-8■■■□□ 19
SRSF7Q16629 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 49.4□□□□□ -0.91e-8■■■□□ 19
SRSF7Q16629 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 49.4□□□□□ -0.91e-8■■■□□ 19
SRSF7Q16629 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 33.51□□□□□ -1.851e-8■■■□□ 19
SRSF7Q16629 SEPT9-245ENST00000592481 1291 ntTSL 517.22■□□□□ 0.351e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 517.18■□□□□ 0.341e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 414.39□□□□□ -0.111e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.211e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-226ENST00000589920 580 ntTSL 212.49□□□□□ -0.411e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 412.05□□□□□ -0.481e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-212ENST00000586128 752 ntTSL 411.67□□□□□ -0.541e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.571e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-209ENST00000585638 565 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 410.11□□□□□ -0.791e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 49.82□□□□□ -0.841e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 29.1□□□□□ -0.951e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 49□□□□□ -0.971e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 58.9□□□□□ -0.981e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 48.29□□□□□ -1.081e-10■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.22■□□□□ 0.035e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 513.09□□□□□ -0.315e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.545e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.645e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 210.97□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 210.97□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.735e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.755e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 510.14□□□□□ -0.795e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.995e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.485e-6■■■□□ 18.9
SRSF7Q16629 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.665e-6■■■□□ 18.9
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SRSF7Q16629 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.717e-6■■■□□ 18.8
SRSF7Q16629 RINT1-208ENST00000497979 2627 ntTSL 59.13□□□□□ -0.957e-6■■■□□ 18.8
SRSF7Q16629 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■■■□□ 18.6
SRSF7Q16629 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.093e-6■■■□□ 18.6
SRSF7Q16629 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 18.6
SRSF7Q16629 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.53e-6■■■□□ 18.6
SRSF7Q16629 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-7■■■□□ 18.5
SRSF7Q16629 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 314.35□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 18.5
SRSF7Q16629 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-7■■■□□ 18.5
SRSF7Q16629 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.913e-7■■■□□ 18.5
SRSF7Q16629 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.75■□□□□ 0.115e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPME1-208ENST00000543525 1928 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.555e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.65e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.665e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SPAG5-214ENST00000582076 719 ntTSL 310.83□□□□□ -0.685e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SPAG5-213ENST00000581133 743 ntTSL 38□□□□□ -1.135e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SPAG5-212ENST00000580682 635 ntTSL 37.31□□□□□ -1.245e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SPAG5-209ENST00000580406 937 ntTSL 36.57□□□□□ -1.365e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.365e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPME1-204ENST00000538501 744 ntTSL 1 (best)5.89□□□□□ -1.475e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPME1-203ENST00000535205 636 ntTSL 25.5□□□□□ -1.535e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SPAG5-204ENST00000577259 651 ntTSL 34.94□□□□□ -1.625e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.745e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)15.03■□□□□ -06e-8■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 59.13□□□□□ -0.952e-10■■■□□ 18.4
SRSF7Q16629 TARDBP-223ENST00000620632 706 ntTSL 38.63□□□□□ -1.032e-10■■■□□ 18.4
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