Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF239Q16600 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF239Q16600 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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ZNF239Q16600 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF239Q16600 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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