Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA4Q16363 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA4Q16363 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA4Q16363 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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