Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMCO1Q147U7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMCO1Q147U7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMCO1Q147U7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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