Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX3Q13185 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CBX3Q13185 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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